基礎研究所前身(shēn)為(wèi)中醫(yī)基礎理(lǐ)論研究室，始建于1964年，重新(xīn)組建後，2012年正式更改為(wèi)基礎研究所。基礎研究所下(xià)設睡眠研究室、骨質疏松研究室，主要從事(shì)中醫(yī)藥基礎和臨床研究、産品研發及名老中醫(yī)傳承工作(zuò)。

基礎研究所承擔着科研與教學兩大任務(wù)，現(xiàn)有全國老中醫(yī)藥專家學術經驗繼承工作(zuò)指導老師1名，福建省名中醫(yī)1名，福建省衛生(shēng)系統有突出貢獻中青年專家2名，一(yī)批博士生(shēng)及碩士生(shēng)導師。擁有國家中醫(yī)藥管理(lǐ)局林求誠名老中醫(yī)傳承工作(zuò)室、2個(gè)福建省中醫(yī)藥重點研究室（中醫(yī)藥防治老年腦功能(néng)障礙研究室和骨質疏松證候基因組學研究室）、福建省中醫(yī)睡眠重點實驗室。基礎研究所重點涉及動物行為(wèi)學、組織形态學、分(fēn)子(zǐ)生(shēng)物學、細胞生(shēng)物學等方面的基礎研究以及與臨床相結合的轉化(huà)醫(yī)學研究，探索從分(fēn)子(zǐ)、細胞、組織、器(qì)官到整體(tǐ)水平，從基礎研究到臨床研究，系統整合生(shēng)物學及中醫(yī)辨證相結合的方式，探討(tǎo)疾病發生(shēng)、發展的規律，為(wèi)制定适合我國國情的疾病防治診療方案提供科學依據。

基礎研究所“十三五”期間(jiān)承擔國家科技部重點研發計劃子(zǐ)課題、國家自然科學基金(jīn)等10項國家級科研項目、32項省部級科研項目。獲得中華中醫(yī)藥學會科技獎、中國中西(xī)醫(yī)結合學會科技獎、福建省科學技術進步獎、福建醫(yī)學科技獎等10餘項獎項；國家發明專利2項、實用新(xīn)型專利2項，成功轉化(huà)專利2項。基礎研究所具有良好(hǎo)(hǎo)的學術交流和合作(zuò)基礎，在相關(guān)學術領域享有較高的聲譽，研究所專家及科研人(rén)員(yuán)在各類專業學術團體(tǐ)擔任重要職務(wù)。中國老年學和老年醫(yī)學學會骨質疏松分(fēn)會中醫(yī)藥專家委員(yuán)會主任委員(yuán)、福建省中醫(yī)藥學會科普分(fēn)會主任委員(yuán)、福建省中西(xī)醫(yī)結合學會骨質疏松分(fēn)會主任委員(yuán)均在基礎研究所。